Modelling of seasonal influenza and estimation of the burden in Tunisia

East Mediterr Health J. 2016 Oct 2;22(7):460-467.

Abstract

The burden of influenza was estimated from surveillance data in Tunisia using epidemiological parameters of transmission with WHO classical tools and mathematical modelling. The incidence rates of influenza-associated influenza-like illness (ILI) per 100 000 were 18 735 in 2012/2013 season; 5536 in 2013/14 and 12 602 in 2014/15. The estimated proportions of influenza-associated ILI in the total outpatient load were 3.16%; 0.86% and 1.98% in the 3 seasons respectively. Distribution of influenza viruses among positive patients was: A(H3N2) 15.5%; A(H1N1)pdm2009 39.2%; and B virus 45.3% in 2014/2015 season. From the estimated numbers of symptomatic cases, we estimated that the critical proportions of the population that should be vaccinated were 15%, 4% and 10% respectively. Running the model for the different values of R0, we quantified the number of symptomatic clinical cases, the clinical attack rates, the symptomatic clinical attack rates and the number of deaths. More realistic versions of this model and improved estimates of parameters from surveillance data will strengthen the estimation of the burden of influenza.

نمذجة الإنفلونزا الموسمية وتقدير العبء في تونس.

صادق شليف، وفاء العيي، جيهان بالطيّب، غسّان خرّوبي، مريم نويرة، رحاب يزيدي، عواطف الموسي، لطيفة معزاوي، أمن سليم، عفيف بن صالح ومجموعة ترصد الإنفلونزا في تونس.

قُدِّر عبء الإنفلونزا من بيانات الترصد في تونس باستخدام معلِّات وبائية لانتقال العدوى مع أدوات منظمة الصحة العالمية الكلاسيكية والنمذجة الرياضية. كانت معدلات وقوع الأمراض الشبيهة بالإنفلونزا المرتبطة بالإنفلونزا 18735 لكل 100000 في موسم 2012- 2013، و 5536 في موسم 2013-2014 و 12602 في موسم 2014-2015. وكانت النسب المقدرة للأمراض الشبيهة بالإنفلونزا المرتبطة بالإنفلونزا من إجمالي المترددين عى القيادات الخارجية % 3.16 و % 0.86 و % 1.98 في المواسم الثلاثة عى التوالي. وكان توزيع فيروسات الإنفلونزا بن المرضى الإيجابين: A(H3N2) %15.5 و 39.2% A(H1N1)pdm2009 وفروس B 45.3% في موسم 2014-2015. ومن خال الأعداد التقديرية للحالات المصحوبة بأعراض قدَرنا أن النسب الحاسمة للسكان الذين ينبغي أن يلقَّحوا كانت % 15 و % 4 و % 10 عى التوالي. وباستخدام النموذج الخاص بالقيم المختلفة ل R0 قدَّرنا - كميا - عدد الحالات السريرية المصحوبة بأعراض، ومعدلات الإصابات السريرية.

Modélisation de la grippe saisonnière et estimation de sa charge en Tunisie.

En Tunisie, la charge de la grippe a été estimée à partir des données de surveillance, en utilisant les paramètres épidémiologiques de la transmission avec les outils classiques de l’OMS et la modélisation mathématique. Les taux d’incidence des syndromes de type grippal (STG) associés à la grippe étaient 18 735 pour 100 000 pour la saison 2012-2013 ; 5 536 pour 2013-2014 et 12 602 pour 2014-2015. La part estimée de STG associés à la grippe pour la charge totale de patients externes était respectivement de 3,16 %, 0,86 % et 1,98 % pour les trois saisons. Parmi les patients positifs au virus de la grippe, la répartition était la suivante pour la saison 2014-2015 : 15,5 % pour le virus A(H3N2) ; 39,2 % pour le virus A(H1N1)pdm2009 ; et 45,3 % pour le virus B. À partir du nombre estimé de cas symptomatiques, nous avons calculé que la proportion critique de la population devant être vaccinée était respectivement de 15 %, 4 % et 10 %. L’exécution du modèle avec les différentes valeurs de R0 nous a permis de déterminer le nombre de cas cliniques symptomatiques, les taux d’attaque clinique, les taux d’attaque clinique pour les cas symptomatiques et le nombre de décès. Des versions plus réalistes de ce modèle ainsi que des estimations améliorées des paramètres issus des données de surveillance permettront d’accroître l’utilité des modèles mathématiques.

MeSH terms

  • Adolescent
  • Adult
  • Aged
  • Child
  • Child, Preschool
  • Cost of Illness*
  • Female
  • Humans
  • Incidence
  • Infant
  • Influenza A Virus, H1N1 Subtype / isolation & purification*
  • Influenza A Virus, H3N2 Subtype / isolation & purification*
  • Influenza, Human / epidemiology*
  • Male
  • Middle Aged
  • Models, Statistical
  • Models, Theoretical*
  • Population Surveillance
  • Seasons*
  • Tunisia
  • Young Adult