[Covid-19 diagnosis : clinical recommendations and performance of nasopharyngeal swab-PCR]

Rev Med Suisse. 2020 Apr 8;16(689):699-701.
[Article in French]

Abstract

The Covid-19 pandemic imposes new diagnostic strategies in order to optimize the medical care of our patients. The current biblio-graphy, although of low quality, shows a sensitivity of 56 to 83 % for the Covid-19 PCR. Even though one negative test can exclude a Covid-19 in the majority of cases, the NPV (Negative Predictive Value) decreases with increasing prevalence (pre-test probability). This finding suggests the need for strict auto-isolation of patients until the resolution of their symptoms. For patients that present with typical symptoms, who have a presumed Covid-19 prevalence of -40-50 %, a negative test should be interpreted with caution and a repeat test may be needed.

La pandémie actuelle du Covid-19 impose une stratégie diagnostique pour la prise en charge des patients. La performance du frottis nasopharyngé avec analyse par PCR peut être estimée sur la base des premières données bibliographiques. Celles-ci, certes de qualité faible, montrent une sensibilité de 56 à 83 % pour la PCR Covid-19. Un seul test négatif permet d’infirmer un Covid-19 dans la majorité des situations. Cependant, comme la valeur ­prédictive négative du test se situe entre 88 et 95 % en cas de ­probabilité prétest de 30 %, il est indispensable d’assurer le suivi de ces patients. Pour ceux qui présentent des symptômes typiques, qui auraient une probabilité prétest présumée à 40-50 %, un test négatif doit être interprété avec précaution et un deuxième test peut être indiqué.

Publication types

  • Review

MeSH terms

  • Betacoronavirus* / isolation & purification
  • COVID-19
  • COVID-19 Testing
  • Clinical Laboratory Techniques*
  • Coronavirus Infections / diagnosis*
  • Humans
  • Pandemics
  • Pneumonia, Viral / diagnosis*
  • Polymerase Chain Reaction / methods*
  • Polymerase Chain Reaction / standards*
  • Predictive Value of Tests
  • SARS-CoV-2
  • Sensitivity and Specificity